1976 m. gegužės 1 d. buvo įsteigtas Lazdijų miesto lopšelis-darželis „Vyturėlis“. 1993 m. įstaiga reorganizuota į naujo tipo švietimo įstaigą – Lazdijų darželį-mokyklą „Vyturėlis“. 2012 m. rugpjūčio 29 d. pakeistas įstaigos pavadinimas į Lazdijų mokykla-darželis „Vyturėlis“.
Pirmaisiais 1993–1994 mokslo metais įstaigoje veikė 6 pradinės klasės (116 mokinių) ir 4 darželio grupės (80 vaikų), dirbo 6 pradinių klasių mokytojos bei 8 darželio auklėtojos. Įstaigai vadovavo direktorė Bronė Varslauskienė.
Nuo 1997 m. mokykloje veikia pailgintos mokymosi dienos grupės, kur mokiniai, prižiūrimi mokytojų, gali ruošti pamokas, žaisti, laukti neformaliojo vaikų švietimo užsiėmimų. 2002–2003 m. m. mokykloje atidaryta priešmokyklinio ugdymo grupė, kurią lankė 11 vaikų.
2008–2020 m. įstaigai vadovavo direktorė Loreta Jurkonienė, nuo 2021 m. ir iki šiol vadovauja direktorė Asta Labalaukienė.
Informacija atnaujinta 2026-06-15